Книга Тайна пропавшего журнала, автором которой является Елена Грохотова, повествует о событиях в обычной российской школе города Нижние Умы. Главным героем является классный журнал 5-Я класса, который внезапно пропадает, вызывая напряжённую ситуацию среди учителей и учеников. Случай происходит в день контрольной по алгебре, и пропажа журнала создает дополнительные трудности при выставлении оценок. Сюжет начинается с того, что после урока и контрольной журнал с результатами не находится в месте хранения, и ни учителя, ни ученики не могут его найти. Весь учебный коллектив, включая директора и педагогов, начинает искать его по всей школе, обыскивая даже мусорные контейнеры и зоны, обычно не предназначенные для хранения школьных документов. Учителя выражают беспокойство из-за близости конца учебного года и необходимости выставления годовых оценок. В ходе поисков появляются различные предположения и версии о судьбе журнала, включая гипотезы об инопланетянах, что вызывает обсуждения среди педагогического состава. Ученики также принимают участие в поисках, выдвигая свои догадки, подшучивая друг над другом и пытаясь выяснить, кто мог взять журнал.

Несмотря на интенсивные поиски, пропажа остается загадкой, что создаёт напряжённую атмосферу в школе. Позже становится известно, что журнал находился у одного из учеников, Саши Жирнякова, который, готовясь к контрольной несколько ночей подряд, заснул в школьной столовой и случайно подложил журнал вместо подушки. Он провёл ночь под столом со своим «хранилищем оценок». После обнаружения Саша оказывается в кабинете директора, где обсуждается его поведение и последствия произошедшего. Учителя решают наложить на него дисциплинарные меры, включая лишение летних каникул на три месяца. Ключевым моментом является урок, который даёт ситуация с пропажей журнала. Важность своевременного усвоения материала и ответственности за свои действия становится очевидной для всех участников событий. В книге показывается, какие сложности могут возникнуть из-за несоблюдения учебной дисциплины и как школа пытается справиться с возникающими проблемами.