«Государь. Обратный отсчёт – 2» Петра Алмазного продолжает историю главного героя, который оказался в теле русского императора Александра II незадолго до его смерти. Герой сталкивается с тем, что его сознание и личность находятся в теле человека, который уже стар и болен, а окружающие не полностью замечают произошедшие перемены в характере и поведении императора. Сюжет начинается с того, что герой пытается разобраться с политической ситуацией и угрозами терроризма в столице. Он участвует в расследовании серии взрывов, пытается предотвратить дальнейшие теракты и ищет виновных среди различных революционных группировок. При этом главный герой ощущает недоверие и страх среди приближённых, что приводит к подозрениям в заговоре против него. Внутренние и внешние конфликты оказывают сильное давление, ухудшая его физическое состояние. В процессе повествования герой ведёт диалоги с различными государственными чиновниками и офицерами, обсуждая методы борьбы с терроризмом и политическими противниками.

Он сталкивается с проблемами организации и координации сил безопасности, узнаёт о существующих дворцовых интригах и противоречиях в действиях представителей власти. В это время состояние здоровья императора ухудшается, проявляются старческие болезни и симптомы нервного истощения. Главная сложность для героя состоит в необходимости принять меры для сохранения власти и безопасности страны, одновременно выстраивая доверие с окружением и избегая обвинений в безумии. Он пытается использовать имеющуюся информацию о террористах, привлечь лояльных людей и провести информационную кампанию против врагов государства. Конфликты между разными группами власти и заговоры усиливают напряжение в жизни героя и усложняют его задачи. В итоге, события показывают, как главный герой, оказавшийся в теле императора в критический период, пытается справиться с угрозами терроризма и политическими интригами, одновременно сталкиваясь с ограничениями физического состояния и недоверием окружающих. Тема выбора и противостояния внутренним и внешним вызовам остаётся центральной для сюжета книги.