«Триединство» Екатерины Боровиковой рассказывает о событиях, которые происходят в мире после некой Катастрофы, значительно изменившей реальность. Главный герой, Егор Кухарев, находится в затруднительном положении — он путешествует по пустыне Вырая, пытаясь выжить и разобраться в происходящем. Его задача осложняется тем, что вокруг него существует множество сверхъестественных существ и опасностей, а сама реальность подвержена искажениям. Сюжет начинает развиваться с того момента, когда Егор получает важную информацию от загадочного персонажа, Вениамина, представляющего нечисть. Егор узнает о существовании особого места — хранилища памяти, закрытого и недоступного большинству. Вениамин предлагает сделку: помощь в доступе к хранилищу в обмен на ответы на определённые вопросы. Это предложение становится отправной точкой для Егора, и впоследствии он начинает поиски этого места, пытаясь получить знания, которые могут помочь понять происходящее.

В процессе расследования и путешествия по различным локациям, Егор сталкивается с другими персонажами и существами, включая ведьму Марину и существа из потустороннего мира. Марина находится в тяжелом состоянии и не может самостоятельно двигаться, что создаёт дополнительную задачу для героя. Помимо путешествия, сюжет включает сцены, описывающие быт и устройство нового мира после Катастрофы, а также проблемы выживания и взаимодействия между различными группами людей и нечистью. Главные конфликты книги связаны с необходимостью принимать сложные решения и балансировать между разными силами, которые пытаются контролировать ситуацию. Егор вынужден справляться с болезнью, преследованиями, недоверием и внутренними сомнениями. В центре внимания находится поиск истины о происхождении изменений в мире, возможность получить контроль над судьбой и понимание роли души и сверхъестественных способностей. Конечные решения героя и его выбор определяют направление дальнейших событий и раскрывают главные темы книги, связанные с знаниями, выживанием и отношениями между мирами.